- Landşaftşünaslıq və landşaft planlaşdırılması şöbəsi
- Geomorfologiya və təbii risklər şöbəsi
- Qurunun hidrologiyası və su ehtiyatları şöbəsi
- İqlim və aqroiqlimşünaslıq şöbəsi
- Azərbaycanın torpaq ehtiyatları coğrafiyası şöbəsi
- Azərbaycanın siyasi və iqtisadi coğrafiyası şöbəsi
- Demoqrafiya və əhali coğrafiyası şöbəsi
- Turizm və rekreasiya coğrafiyası şöbəsi
- Xəzər dənizinin hidrometeorologiyası şöbəsi
- Xəzər dənizi sahillərinin və dibinin geomorfologiyası şöbəsi
- Xəzər dənizinin monitorinqi şöbəsi
- Geoinformatika və kartoqrafiya şöbəsi