На основании постановления № 65 Кабинетов Министров Азербайджанской Республики от 15 марта 2012 года об утверждении «Классификации специальностей высшей школы по уровню докторантуры», которое было принято на основании Указа Президента АР «Об исполнении Закона АР «Об образовании» (№ 156, раздел 2.2. от 05.09.2009 г.) с учетом предложений от Высшей Аттестационной Комиссии при Президенте АР, Национальной Академии Наук Азербайджана, Министерства Образования АР, Министерства Экономического Развития АР, Государственной Комиссии по приему студентов АР Институт Географии имени акад. Г.А. Алиева проводит обучение в докторантуре по следующим специальностям:  

2508.01 – Геоэкология

2529.01 – Картография и геоинформатика – научное направление объединяющее в себе исследования по картографии и геоинформатике.

5401.01 – Экономическая география – экономическая география основываясь на эффективности географического распределения труда изучает территориальную организацию производительных сил общества в глобальном, региональном, государственном, районном и локальном (местном) масштабах.

5402.01 - Историческая география, политическая и рекреационная география - Учитывая условия отдыха, труда и быта, развитие личности, жизненную деятельность человека, вторичное производство и освоение окружающей среды в различных исторических и социальных условиях изучает пространственные особенности жизнедеятельности человека, формы территориальной организации туризма и рекреации. Политическая география изучает геополитические структуры и формирование политической карты мира, пространственную организацию политической жизни в рамках регионов и отдельных стран, а также ее взаимосвязь с размещением и территориальным соответствием политических сил. Основной задачей, встающей перед исторической географией, политической и рекреационной географией, является формирование их теоретических основ, закономерностей территориальной организации историко-географических процессов и социальной инфраструктуры, предложение практических рекомендаций по прогнозированию имеющих место изменений на политической карте мира.

5403.01 – География человека – являясь одним из разделов экономической географии исследует географические закономерности размещения населения и населенных пунктов, демографическое развитие, возрастной, половой, а также национально-этнический состав населения, структуру системы расселения в различных природных, исторических, социально-экономических условиях.

5404.01 – Региональная география – комплексная наука, систематизирующая подробную информацию о странах, их различных регионах, а также об их природе, географическом положении, населении, хозяйстве, культурной и социально-политической организации. Предметом изучения региональной географии является исследование формирования ее теоретических основ, обоснование рациональной территориальной организации в региональном и локальном масштабе, а также предложение практических рекомендаций в этой области.

5405.01 – Атмосфера – научная дисциплина, объединяющая в себе исследования по физике атмосферы, метеорологии, климатологии.

5406.01 – Гидрология – научная дисциплина, изучающаяводные объекты сушии протекающие в них процессы, закономерности распределения речного стока во времени и в пространстве, качество воды.

5407.01 – Океанология – комплекс наук, изучающих физические, химические, биологические и др. процессы, происходящие в мировом океане, с учетом астрономических и антропогенных факторов и их связей с атмосферными и литосферными процессами.

5408.01 – Физическая география и биогеография, география почв, геофизика и геохимия ландшафтов – научное направление исследующее внутреннее строение (структуру), образование, эволюцию и механизмы деятельности ландшафтной сфера Земли и ее различных составных частей (почвенного и растительного покровов, животного мира, климата, рельефа, поверхностных вод, геологического строения и т.д.).

5409.01 – Геоморфология – научная дисциплина, объединяющая в себе исследования по геоморфологии и эволюционной географии.

5410.01 – Гляциология и криология - научная дисциплина, изучающая различные типы оледенения – ледники, подземные льды, снежный покров, снежные лавины, морские и речные льды, а также формирование льда в совокупности, исследует генезис, распространение и эволюцию криосферы Земли в целом.

5411.01 – Метеорология - научная дисциплина, объединяющая в себе исследования по метеорологии, климатологии агрометеорологии.