З.Н. Эминов родился в 1967 году в селе Юхары Гараманлы Нефтчалинского района Азербайджанской Республики.
В 1991 году он с отличием окончил Бакинский государственный университет и начал работать старшим лаборантом в Институте географии Национальной академии наук Азербайджана.
С 2017 года назначен заведующим кафедрой «География человека» института, заведующим вновь созданной кафедрой «Медицинская география».
В 1995 году окончил аспирантуру Центра экономических реформ Министерства экономики Азербайджанской Республики. В 1997 году он защитил кандидатскую диссертацию на тему «Формирование и развитие Единой системы расселения населения (ЕМС) в Азербайджанской Республике (на примере Гянджа-Казахского экономического района)» в Институте Экономики НАНА и получил степень кандидата экономических наук. В 2007 году З.Н. Эминову присвоено звание доцента.
В сентябре 2012 года З.Н. Эминов защитил докторскую диссертацию на тему «Демографические проблемы формирования трудовых ресурсов в Азербайджане».
З.Н.Эминов изучает социально-демографическое положение населения в Азербайджанской Республике и других странах с переходной экономикой, использование трудовых ресурсов, развитие поселений, экономические реформы и их влияние на эти процессы. Он является автором около 90 научных статей и диссертаций, 10 монографий и 10 книг по экономическим и социально-демографическим проблемам расселения населения в Азербайджане. Его научные работы опубликованы в США, Великобритании, Российской Федерации, Украине, Узбекистане, Казахстане, Болгарии, Румынии и др. странах.
Большое значение имеют авторские «Население Азербайджана», «Экономическая, социальная и политическая география Азербайджанской Республики (процессы, проблемы, конструктивные аспекты)» (совместно с Н.А.Пашаевым и Н.Х.Эюбовым, Баку, 2010) и другие монографии.
З.Эминов, принимавший непосредственное участие в подготовке «Национального Атласа Азербайджанской Республики» и составлении экономических, социальных и демографических карт, является автором около 17 карт.
Он является соавтором трёхтомника «География и этнос тюркского мира» (на азербайджанском и русском языках) и двухтомника «География Нахчыванской Автономной Республики».
З.Н.Эминов провёл большую работу по преподаванию географии и её популяризации среди широкой читательской аудитории, подготовил большой объём книг и материалов. В 2012 году З.Н. Эминов (совместно с Г.М. Самадовым) подготовил двухтомное учебное пособие «Географическую энциклопедию», предназначенную для средних школ. В 2015 году является соавтором учебника «География» и «Методических материалов для учителей» для VIII классов на основе учебной программы, преподаваемой в общеобразовательных школах.
Ученый удостоен Государственной премии Азербайджанской Республики в области науки в 2016 году как один из основных авторов второго (Экономическая, социальная и политическая география) и третьего (Региональная география) томов трехтомного фундаментального труда «География Азербайджанской Республики», подготовленного Институтом географии в 2015 году.
Закир Эминов- один из авторов и главный организатор книг, подготовленных Институтом Географии после освобождения наших территорий от оккупации "Демографическое развитие сел Азербайджанской Республики и проблемы расселения сельского населения" , "Социально-демографическое развитие Иреванской губернии и проблемы сохранения топонимии", "Проблемы демографического развития и расселения населения в Аранском экономическом районе" , «География Карабаха и Восточного Зангезура: природно-географические условия и потенциал социально-экономического развития», «География Шушинского административного района: природные условия и потенциал социально-экономического развития», «Современное состояние качества жизни населения Азербайджанской Республики»».Особо следует отметить его заслуги в подготовке и издании книги «История и топонимия этнического расселения Карабаха».
Преподавательская деятельность З.Н. Эминова связана с БГУ и АДПУ. В настоящее время он является научным руководителем 1 докторской диссертации, 5 диссертаций на степень д.ф.г. и 5 докторантов. На данный момент под его научным руководством 7 человек защитили кандидатские диссертации по географии.
Решением ВАК при Президенте Азербайджанской Республики от 14.09.2023 года Закиру Эминову за научную деятельность было присвоено ученое звание профессора.
С 2021 года З.Н.Эминов является генеральным директором Института географии.